Las formas a favor y en favor solo son equivalentes en algunos contextos.

Con el significado ‘en beneficio o provecho de alguien’, las locuciones a favor y en favor se pueden usar indistintamente. En este caso se construyen siempre con un complemento introducido por de o por un posesivo: en favor de, a favor de, en su favor, a su favor.

En cambio, si se quiere decir ‘en el mismo sentido que una fuerza o corriente y recibiendo, por tanto, su ayuda’ («Se fue caminando a favor del viento, como un velero»), no es admisible el uso de en favor de.